Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms