Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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