Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sgo1Q9CXH7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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