Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms