Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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