Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snw1Q9CSN1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms