Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TpbpbQ9CQC0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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TpbpbQ9CQC0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TpbpbQ9CQC0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TpbpbQ9CQC0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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