Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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