Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Commd4Q9CQ02 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms