Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms