Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdpd3Q99LY2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdpd3Q99LY2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdpd3Q99LY2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdpd3Q99LY2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gdpd3Q99LY2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms