Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nus1Q99LJ8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nus1Q99LJ8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nus1Q99LJ8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nus1Q99LJ8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nus1Q99LJ8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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