Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms