Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms