Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ctu1Q99J10 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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