Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd3Q91W18 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms