Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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