Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms