Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

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Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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