Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrit1Q8K099 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms