Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms