Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms