Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm11149-202ENSMUST00000215070 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 A530006G24Rik-201ENSMUST00000152542 1331 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trim35Q8C006 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trim35Q8C006 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trim35Q8C006 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm45286-201ENSMUST00000209267 1350 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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