Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsfm13Q8BXS2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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