Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms