Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca8Q8BHX3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms