Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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