Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrrc1Q80VQ1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms