Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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