Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms