Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek5Q7TSC3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek5Q7TSC3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek5Q7TSC3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek5Q7TSC3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek5Q7TSC3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek5Q7TSC3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek5Q7TSC3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms