Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms