Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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