Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trim37Q6PCX9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim37Q6PCX9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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