Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smchd1Q6P5D8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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