Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tpm4Q6IRU2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm4Q6IRU2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms