Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms