Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms