Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usf2Q64705 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usf2Q64705 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usf2Q64705 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms