Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sdc3Q64519 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc3Q64519 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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