Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms