Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cln3Q61124 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cln3Q61124 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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