Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms