Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms