Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lin28bQ45KJ6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28bQ45KJ6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms