Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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