Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms