Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms