Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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