Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx21Q3UR97 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx21Q3UR97 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms